As comissões do Programa de Pós-Graduação em Ciências Ambientais - PPGCA visam auxiliar o Colegiado na execução das atividades administrativas do Programa, podendo apresentar caráter permanente ou temporário.

Atualmente, as comissões permanentes do PPGCA são: Comissões de Bolsas e Auxílios, de Credenciamento e Recredenciamento de Docentes, de Divulgação, de Eventos e de Seleção.